Hovedforskellen mellem flercellede og encellede er, at flercellede organismer har mere end en celle, mens encellede organismer kun har en enkelt celle.
Baseret på cellenummeret er der to kategorier af organismer. De er nemlig encellede og flercellede organismer. Adfærd, anatomi og funktionaliteten af encellede og multicellulære organismer varierer mellem hinanden. Multicellulære organismer er de organismer, der består af mere end en celle. De er komplekse organismer, der har forskellige funktionaliteter. På den anden side kaldes encellede organismer også encellede organismer, der kun består af en celle. Således har de enkle biologiske processer.