Hovedforskellen mellem bioreaktor og fermentor er typen af biokemisk reaktion, der finder sted inde i de lukkede kar. En bioreaktor letter alle typer biokemiske reaktioner, men en fermentor letter kun fermentering.
Anvendelsen af bioteknologi i branchen er et interessant videnskabsområde. Disse applikationer varierer fra mikrobielle applikationer til den dyrebaserede applikation. Desuden varierer de industrielle anvendelser af bioteknologi på tværs af hovedområder som landbrug, medicin og forskellige industrier. Bioreaktorer er lukkede kar, hvor de nødvendige betingelser er skabt for at lette forskellige typer biokemiske reaktioner. Fermentorer tilhører gruppen af bioreaktorer, men det er især kun at udføre fermentering.
