Hovedforskellen mellem flora og fauna er, at floraen henviser til plantelivet i en bestemt region, mens faunaen henviser til dyrelivet i en bestemt region.
Flora og fauna er to generelle udtryk, der bruges til at henvise til henholdsvis planter og dyr i en bestemt region. Da flora repræsenterer alle planter, kan vi sige, at flora omfatter alle immobile autotrofiske fotosyntetiske organismer. På samme måde kan vi sige, at fauna inkluderer alle mobile heterotrofiske organismer, der er afhængige af andre for fødekilder. Derfor bruges disse ord flora og fauna for det meste til at beskrive plante- og dyrelivet i en region eller et område. Både flora og fauna på et bestemt sted er vigtige af nogle årsager, især af økologiske grunde. Begge planter såvel som dyr, der er hjemmehørende et sted, opretholder den økologiske balance, og forskere holder styr på alle arter for at se, om nogen af disse arter står over for fare for udryddelse. Forskere og miljøforkæmpere arbejder derefter i tæt samarbejde for at udvikle metoder til at genoprette denne sarte økologiske balance.