Hovedforskellen mellem bakterier og bløddyr er, at bakterier generelt har en peptidoglycan cellevæg, mens bløddyr er en klasse af bakterier, der ikke har en cellevæg.
Bakterier er de mest rigelige mikroorganismer, der findes i naturen. De er en gruppe af encellede organismer, der lever overalt. Desuden er de prokaryote organismer. Derfor mangler de en kerne og membranbundne organeller. Der er forskellige grupper af bakterier. Nogle af dem tilhører en fotosyntetisk bakteriegruppe kaldet cyanobakterier. Generelt har de fleste bakterier en stiv cellevæg. Imidlertid besidder nogle bakteriegrupper ikke denne cellevæg. Bløddyr er sådan en klasse af bakterier, der mangler en cellevæg. Derfor diskuterer denne artikel forskellen mellem bakterier og bløddyr.
