Hovedforskellen mellem MS og borreliose er, at borreliose er en infektiøs sygdom, mens MS ikke er en inflammatorisk sygdom uden infektiøs oprindelse. Multipel sklerose er en kronisk autoimmun, T-celle-medieret inflammatorisk sygdom, der påvirker centralnervesystemet. Lyme-sygdommen er på den anden side forårsaget af en spirochete ved navn Borrelia burgdoferi, der kommer ind i menneskekroppen gennem bid af lus eller flåter.
Både multipel sklerose og Lyme-sygdom er sygdomme, der kan påvirke vores neurologiske system.
