Hovedforskellen mellem fordøjelse af heterotrofer og saprotrofer er, at fordøjelsen af heterotrofer er intracellulær, mens fordøjelsen af saprotrofer er ekstracellulær.
Fordøjelse er en vigtig proces for organismernes overlevelse. Gennem denne proces bliver næringsstoffer tilgængelige for absorption af organismerne. Heterotrof fordøjelse er processen med intracellulær fordøjelse i organismer, der er afhængige af organisk mad. Saprotrof fordøjelse er processen med ekstracellulær fordøjelse, hvor organismerne er afhængige af dødt organisk materiale. Både fordøjelse af heterotrofer og saprotrofer er vigtig for biosfærens overlevelse. Heterotrofer afhænger af organisk materiale fra planter og andre dyrekilder. På den anden side afhænger saprotrofer direkte af dødt organisk stof for deres ernæring. Derfor lærer disse fordøjelsesmønstre at studere ernæringsmæssige forhold i organismer.
