Transposon vs Retrotransposon
Transposoner og retrotransposoner er genetiske komponenter i DNA, og der er store forskelle mellem dem. Den procentvise tilstedeværelse af disse genetiske materialer varierer på tværs af arter, og deres funktioner bestemmer skæbnen for organismen med mutationer og andre fænotypisk vigtige ændringer. Transposoner og retrotransposoner er gener eller samlinger af visse gener placeret i DNA-strengene, og ændringer af deres placeringer har været hovedårsagerne til disse konsekvenser. Imidlertid har denne artikel til hensigt at diskutere funktionerne af disse gener kort og præsenterer en sammenligning mellem transposoner og retrotransposoner.
Hvad er Transposon?
Transposoner er interessante fragmenter eller segmenter af DNA med evnen til at ændre placeringen af DNA-strengen i form af en klip- og pasta-mekanisme. På grund af transposons mobilitet er disse kendt som springende gener. Transposoner er af to hovedtyper kendt som klasse I-transponer og klasse II-transponer. Normalt betegnes klasse II-typen som transposoner, og klasse I-typen kaldes retrotransposoner. Processerne til skæring og indsætning af mobile DNA-segmenter reguleres af enzymtransposasen. Enzymet binder til begge ender af transposonet og skærer phosphodiesterbindingerne af DNA-strengen, isolerer transposonet, flytter det til målstedet og binder det nye sted. Denne proces er dog interessant at forstå,da nogle transposoner kun kan bevæge sig til bestemte placeringer kun på grund af uforeneligheden af basesekvenser med målstedet. Gener med den ene ende af en enkelt streng har den samme basesekvens med den anden ende af den anden enkelt streng er transposoner med klæbrige kanter, fordi de kan binde til stedene i mål-DNA-strengen med samme basesekvens som i de klæbrige ender. Imidlertid kan denne mobilitet af gener forårsage ændringer i genotypen såvel som i organismenes fænotype. Forskere opfandt om transposoner og genetisk modificeret mad og organismer i henhold til de foretrukne tilpasninger blev derefter gjort tilgængelige. Meget produktive landbrugsafgrøder, antibiotika med medicinske egenskaber,husdyr var nogle af de fordelagtigt udviklede produkter efter opfindelsen af transposons af Barbara McClintock i 1940'erne.
Hvad er Retrotransposon?
Retrotransposoner er klasse I transposoner, og disse bevæger sig gennem genomet gennem mekanismen for kopiering og indsætning. Mekanismen for retrotransposons mobilitet involverer få hovedtrin, såsom kopiering af gensegmentet af DNA-strengen til RNA, overførsel af kopien af RNA til målstedet, transkription af RNA-sekvensen tilbage til DNA ved anvendelse af revers transkriptase og indsættelse af genet ind i den nye placering af DNA-streng af genomet. De to ender af disse retrotransposoner har sædvanligvis lange terminale gentagelser med ca. 1000 basepar, og de anvendes som identifikationsegenskaber for disse gener. Disse gener amplificeres let inde i genomet, og procentdelen af retrotransposoner i det humane genom er ca. 50%. Disse kunne være ret farlige, da den forårsagende virus af AIDS, HIV,og T-celle-leukæmivirus har retrotransposoner i deres RNA-genomer. Faktisk kan disse vira binde retrotransposoner til et hvilket som helst sted i de humane DNA-tråde ved anvendelse af revers transkriptase og integrase. Integraseenzymet fungerer på samme måde som transposase i klasse II-transposoner.
Hvad er forskellen mellem Transposon og Retrotransposon?
• Transposoner er klasse II-hoppende gener, mens retrotransposoner falder i kategorien klasse I.
• Transposoner fungerer med transposaseenzymet, mens retrotransposoner fungerer ved brug af to hovedenzymer kendt som reverse transcriptase og integrase.
• Terminalenderne er meget længere i retrotransposoner end i transposoner.
• Transposoner skæres fra oprindelsen og indsættes på målet; omvendt retrotransposoner, der kopieres fra oprindelsen til RNA og transkriberes ved målet.
• Flytning af retrotransposoner involverer RNA, men ikke i transposoner.
