Hovedforskellen mellem apomorphy og plesiomorphy er, at apomorphy refererer til en egenskab, der er unik for en klade og findes i alle efterkommere af den pågældende klade, mens plesiomorphy refererer til en egenskab, der er til stede i kladen, men muligvis ikke alle medlemmer af kladen.
I fylogenetik er kladistik det område, der klassificerer organismer i klader eller grupper baseret på de egenskaber, der arver af forfædrene. Det er en meget pålidelig form for undersøgelse, der hjælper med at analysere evolutionære og fylogenetiske forhold. Forskellige terminologier kan anvendes til at beskrive karakteristika for hver klade, såsom apomorfi, plesiomorfi, autapomorfi, synapomorfi og homoplasi osv. Blandt dem er apomorfi og plesiomorfi relative udtryk. I disse undersøgelser er computerbaseret software virkelig nyttigt til at studere egenskaberne og funktionerne ved Apomorphy og Plesiomorphy.
