Hovedforskellen mellem kemotaxis og fagocytose er, at chemotaxis er en rettet migration af celler eller en organisme langs en kemisk koncentrationsgradient, mens fagocytose er en mekanisme, der opslæmmer fremmede infektiøse partikler for at neutralisere eller ødelægge dem.
Leukocytter er vigtige celler i immunsystemet. De er hvide blodlegemer. Nogle leukocytter er fagocytter. Fagocytter bruger fagocytose til at opsluge fremmede partikler. Monocytter, neutrofiler og makrofager er nogle eksempler på fagocytter. For at nå antigener eller fremmede partikler bruger fagocytter kemotaxis. Chemotaxis er bevægelse af celler eller organismer mod eller væk fra de kemiske stimuli. Desuden mobiliseres fagocytter og immunceller til stedet for infektion, vævsskade og immunreaktioner gennem kemotaxis.
