Hovedforskellen mellem bioakkumulering og biomagnifikation er, at bioakkumulering refererer til opbygningen af et giftigt kemikalie i kroppen af en levende organisme, mens biomagnifikation er stigningen i koncentrationen af et giftigt kemikalie, når man går langs en fødekæde.
Fødevarekæder er vigtige indbyrdes forbindelser mellem organismerne i økosystemerne. Det starter med en primær producent, hovedsagelig en plante, der er fotoautotrof. Planter producerer mad til sig selv ved hjælp af sollys og uorganiske kulstofkilder. Planteædere indtager det andet niveau i en fødekæde Næste niveauer er almindeligt optaget af omnivorer og kødædere. Fødevarekæder forklarer pænt afhængigheden af hvert niveau for mad. Ligeledes overføres den mad, der produceres i det nederste niveau, til de øvre niveauer. Sammen med maden kan uanset hvilke stoffer i de lavere trofiske niveauer også overføres til de øvre niveauer sammen med næringsstofferne. Bioakkumulering og biomagnifikation er to fænomener relateret til overførsel af skadelige stoffer langs fødekæderne til de øvre niveauer.