Hovedforskellen mellem grøn kemi og miljøkemi er, at grøn kemi er en kemisk teknik, mens miljøkemi er en disciplin.
Grøn kemi er affaldshåndtering. Men det inkluderer håndtering af affald, der produceres under en bestemt kemisk proces. I ovenstående nøgleforskel betyder en disciplin “en gren af viden”. Derfor er miljøkemi en gren af viden, hvor vi kan studere kemiske aspekter af kemi. Denne gren af kemi inkluderer analyse af forurenende stoffer i naturen og analyse af jord med mange andre områder.