Hovedforskellen mellem oligopeptid og polypeptid er, at oligopeptider indeholder få aminosyrerester, hvorimod polypeptider indeholder et stort antal aminosyrerester.
Udtrykkene oligopeptider og polypeptider hører under kategorien proteiner. Peptider er korte kæder af aminosyrer. Aminosyrer binder hinanden gennem peptidbindinger. Derfor kan vi kategorisere disse peptider efter antallet af aminosyrer, der er til stede i disse peptider. F.eks. Dipeptider, tripeptider, tetrapeptider, oligopeptider og polypeptider.