Polypeptid vs protein
Aminosyre er et simpelt molekyle dannet med C, H, O, N og kan være S. Det har følgende generelle struktur.
Der er ca. 20 almindelige aminosyrer. Alle aminosyrer har en -COOH, -NH 2 grupper og en -H bundet til et carbonatom. Kulstof er et chiralt kulstof, og alfa-aminosyrer er de vigtigste i den biologiske verden. R-gruppen adskiller sig fra aminosyre til aminosyre. Den enkleste aminosyre, hvor R-gruppen er H, er glycin. Ifølge R-gruppen kan aminosyrer kategoriseres i alifatiske, aromatiske, ikke-polære, polære, positivt ladede, negativt ladede eller polære uladede osv. Aminosyrer til stede som zwitterioner i den fysiologiske pH 7,4. Aminosyrer er byggestenene i proteiner. Når to aminosyrer går sammen til dannelse af et dipeptid, kombinationen finder sted i en -NH 2gruppe af en aminosyre med –COOH-gruppen af en anden aminosyre. Et vandmolekyle fjernes, og den dannede binding er kendt som en peptidbinding.
Polypeptid
Kæden dannes, når et stort antal aminosyrer er forbundet, er kendt som et polypeptid. Proteiner består af en eller flere af disse polypeptidkæder. Den primære struktur af et protein er kendt som et polypeptid. Fra de to terminaler i polypeptidkæden er N-terminalen, hvor aminogruppen er fri, og c-terminalen er, hvor carboxylgruppen er fri. Polypeptider syntetiseres ved ribosomer. Aminosyresekvensen i polypeptidkæden bestemmes af kodonerne i mRNA.
Protein
Proteiner er en af de vigtigste typer makromolekyler i levende organismer. Proteiner kan kategoriseres som primære, sekundære, tertiære og kvaternære proteiner afhængigt af deres strukturer. Sekvensen af aminosyrer (polypeptid) i et protein kaldes en primær struktur. Når polypeptidstrukturer foldes i tilfældige arrangementer, er de kendt som sekundære proteiner. I tertiære strukturer har proteiner en tredimensionel struktur. Når få tredimensionelle proteindele binder sammen, danner de de kvaternære proteiner. Den tredimensionelle struktur af proteiner afhænger af hydrogenbindinger, disulfidbindinger, ionbindinger, hydrofobe interaktioner og alle andre intermolekylære interaktioner inden for aminosyrer. Proteiner spiller flere roller i levende systemer. De deltager i dannelse af strukturer. For eksempel,muskler har proteinfibre som kollagen og elastin. De findes også i hårde og stive strukturelle dele som negle, hår, hove, fjer osv. Yderligere proteiner findes i bindevæv som brusk. Bortset fra den strukturelle funktion har proteiner også en beskyttende funktion. Antistoffer er proteiner, og de beskytter vores kroppe mod fremmede infektioner. Alle enzymer er proteiner. Enzymer er de vigtigste molekyler, der styrer alle de metaboliske aktiviteter. Yderligere deltager proteiner i cellesignalering. Proteiner produceres på ribosomer. Proteinproducerende signal sendes til ribosomet fra generne i DNA. De krævede aminosyrer kan komme fra kosten eller kan syntetiseres inde i cellen. Protein denaturering resulterer i udfoldelse og desorganisering af proteinenes sekundære og tertiære strukturer. Dette kan skyldes varme, organiske opløsningsmidler, stærke syrer og baser, rengøringsmidler, mekaniske kræfter osv.
Hvad er forskellen mellem polypeptid og protein?
• Polypeptider er aminosyresekvenser, hvorimod proteiner fremstilles af en eller flere polypeptidkæder.
• Proteiner har en højere molekylvægt end polypeptider.
• Proteiner har hydrogenbindinger, disulfidbindinger og andre elektrostatiske interaktioner, som styrer dens tredimensionelle struktur i modsætning til polypeptider.
