Hovedforskellen mellem biomining og bioleaching er, at biomining er teknikken til at bruge prokaryoter eller svampe til at udvinde metaller fra mineraler, mens bioleaching er teknikken til at bruge bakterier til at ekstrahere metaller fra mineraler.
Der er flere forskellige metoder, der kan bruges til at ekstrahere metaller fra deres malm eller mineralaffald. De fleste af disse teknikker bruger kemiske reagenser til denne ekstraktion. Derfor er skadelige biprodukter og skadelige miljøpåvirkninger et almindeligt problem med denne teknik. Biomining og bioleaching er teknikker, der bruges til at ekstrahere metaller fra deres malm ved hjælp af levende organismer.