Hovedforskellen mellem transaldolase og transketolase er deres funktion. Transaldolase katalyserer omdannelsen af sedoheptulose 7-phosphat og glyceraldehyder 3-phosphat til erythrose 4-phosphat og fructose 6-phosphat, mens transketolase katalyserer omdannelsen af xylulose 5-phosphat og ribose 5-phosphat til glyceraldehyd 3-phosphat og sedoheptulose 7-phosphat.
Pentose-phosphatvejen er en metabolisk vej, der finder sted parallelt med glykolyse. Den består af to forskellige stier. I pentose-phosphatvejen genereres NADPH i den oxidative fase, mens pentose-sukker genereres i den ikke-oxidative fase. Foruden pentoser og NADPH genererer denne vej ribose 5-phosphat, som er en forløber for nukleotidsyntese. Transaldolase og transketolase er to enzymer involveret i den ikke-oxidative fase af pentose-phosphatvejen.