Hovedforskellen mellem mesofyl og bundtkappeceller er, at i C4-planter finder lysafhængige reaktioner af fotosyntese sted i mesofylcellerne, mens lysuafhængige reaktioner eller Calvin-cyklus finder sted i bundtkappecellerne.
C4 planter er en gruppe planter, der udfører C4 fotosyntese eller C4 kulstoffiksering. Disse planter er i stand til at minimere fotorespiration ved at adskille den indledende CO2-fiksering og Calvin-cyklussen i rummet. For at gøre dette har de et specielt cellearrangement kaldet Kranz leaf anatomy. I Kranz-anatomi er hvert vaskulært bundt omgivet af bundt-kappeceller. Mesophyll-celler omgiver derefter bundt-kappeceller.
Mesophyll og bundtkappeceller har strukturelt og funktionelt forskellige kloroplaster. Mesophyll celler har tynde cellevægge og tilfældigt arrangerede kloroplaster med stablet thylakoids. De har ikke stivelsesgranulat. På den anden side har bundkappeceller tykke cellevægge og centrifugalt arrangerede kloroplaster med store stivelsesgranuler.
