Hovedforskellen mellem centromer og kromomer er, at centromer er en indsnævret region, der forbinder søsterkromatider sammen i et kromosom, mens kromomer er en lineært arrangeret perle-lignende struktur til stede langs kromosomets længde.
Et kromosom er en trådlignende struktur sammensat af nukleinsyrer og proteiner. De indeholder en organisms genetiske information. Der er flere forskellige regioner i et kromosom, herunder kromatider, centromer, kromomer og telomer. Centromeren er det synlige indsnævringspunkt i kromosomet. Det forbinder søsterkromatider og er vigtigt under celledelingen. I modsætning hertil er kromomerer tæt krøllet kromatin til stede i længden af kromosomet. De vises som perler på en streng. De bærer gener under arv.
