Hovedforskellen mellem kandidatgen og GWAS er, at kandidatgentilgang undersøger den genetiske variation inden for et lille antal forud specificerede gener af interesse, mens GWAS undersøger hele genomet for en fælles genetisk variation bag en bestemt sygdomstilstand.
Kandidatgen tilgang og genom-wide association studier (GWAS) er to metoder, der er vigtige for at detektere genetisk modtagelighed for sygdomme. Kandidatgentilgang er baseret på et forud specificeret lille antal gener, mens GWAS er baseret på test af hele genomet. Derfor kræver kandidatgen tilgang forudgående kendskab til gener med relevans for sygdommen, i modsætning til GWAS.
