Hovedforskellen mellem substratspecificitet og bindingsspecificitet er, at substratspecificitet er et enzyms evne til at vælge det nøjagtige substrat, det kan binde til fra en gruppe af lignende forbindelser, hvorimod bindingsspecificitet er et enzyms evne til at vælge substrater med lignende bindinger og lignende strukturer.
Udtrykkene substratspecificitet og bindingsspecificitet kommer under feltet biokemi med hensyn til enzymers aktivitet. Vi kan definere et enzym som en biologisk katalysator. Det betyder, at enzymer er forbindelser, der kan forbedre hastigheden af biologiske funktioner, der finder sted i celler, men de forbruges ikke under funktionen. Udtrykket specificitet henviser til den måde, hvorpå et bestemt enzym binder sig til et bestemt substrat.
