Hovedforskellen mellem histopatologi og cytologi er, at histopatologi er studiet af syge væv ved hjælp af et mikroskop, mens cytologi er studiet af individuelle celler i kroppen.
Celler er de grundlæggende strukturelle enheder i livet. Under diagnosen sygdomme i medicin undersøges celler og hele væv af patologer. Undersøgelsen af væv i relation til sygdom er kendt som histopatologi. I modsætning hertil er undersøgelsen af en enkelt celletype kendt som cytologi. Derfor ser histopatologi på væv, mens cytologi ser på individuelle celler.
