Hovedforskellen mellem allograft og autograft er, at allotransplantat er et knogletransplantat taget fra en donor (en anden person), mens autograft er et knogletransplantat taget fra patienten selv.
Allograft og autograft er to almindelige typer humane knogletransplantater, der anvendes til graftleveringsprocedurer for at helbrede knogleskader. Afhængig af skaden vælger kirurger et passende transplantat til operationen. Autograft er fra selve patientens krop, mens allograft er fra en donor. Succesgraden for autotransplantation er højere end allotransplantation. Desuden er risikoen for infektion også høj i allotransplantationer end autotransplantater.