Hovedforskellen mellem organisk og uorganisk nitrogen er, at det organiske nitrogen er det nitrogen, der forekommer i organiske forbindelser, mens det uorganiske nitrogen er nitrogen, der forekommer i uorganiske forbindelser.
Organiske forbindelser er kemiske arter, der indeholder C- og H-atom som essentielle komponenter. Når disse forbindelser også indeholder nitrogen, er dette nitrogen organisk nitrogen. Uorganiske forbindelser er kemiske arter, der har andre kemiske grundstoffer end kulstof og brint. Men der kan også være kulstof og brint i uorganiske forbindelser. Det er dog ikke vigtigt at have disse kemiske grundstoffer som for organiske forbindelser. Derefter er nitrogenatomer bundet til disse forbindelser uorganisk nitrogen. Vi bruger disse udtryk primært med hensyn til jordkemi.