Hovedforskellen mellem klassisk og moderne genetik er, at den klassiske genetik er den mandeliske genetik eller det ældre koncept for genetik, som udelukkende udtrykkes på baggrund af fænotyperne, der er resultatet af avlsforsøg, mens den moderne genetik er det nye koncept med genetik, som tillader direkte undersøgelse af genotyper sammen med fænotyper.
Den store videnskabsmand Gregor Mendel er far til genetik. Mendel indførte flere love vedrørende arv af træk og hvordan egenskaberne overføres fra forælder til afkom. Således blev hans fund grundlaget for det helt nye koncept, der blev opdaget senere i genetik. Derfor er klassisk genetik og moderne genetik to forskellige begreber. Klassisk genetik er dog grundlaget for moderne genetik.