Hovedforskellen mellem somatisk variation og germinal variation er, at somatisk variation er den genetiske variation, der forekommer i somatiske celler, mens germinal variation er den genetiske variation, der forekommer i kimceller såsom æg eller sædceller.
Genetisk variation refererer til processen med at ændre det genetiske materiale i en organisme eller forskellen i DNA-sekvenser mellem individer inden for en population. DNA-sekvenser underkastet ændringer med tiden i en generation til generation. Genetisk rekombination er en af de vigtigste mekanismer, der forårsager genetisk variation. Desuden kan mutation også forårsage genetisk variation. Genetisk har flercellede organismer to hovedtyper af celler; somatiske celler og kimceller. Derfor er genetisk variation af to typer; de er den somatiske variation og germinal variation. Hvis den genetiske variation forekommer i somatiske celler, kalder vi det en somatisk variation, og hvis den genetiske variation forekommer i kimcellerne, kalder vi den germinal variation. Somatiske variationer er for det meste ikke-arvelige, mens germinal variationer for det meste er arvelige.