Hovedforskellen mellem kulhydrater og lipider er, at kulhydraterne er umiddelbare energikilder i levende organismer, mens lipiderne fungerer som en langsigtet energiressource og har tendens til at blive brugt i en langsommere hastighed.
Kulhydrater og lipider er vigtige næringsstoffer i levende organismer. De er organiske forbindelser, og de tjener som nøglekilder til energi. Derfor tager vi kulhydrater og lipider fra vores kost, da de er vigtige for en sund krop. Både kulhydrater og lipider udgør kulstof, brint og ilt. Strukturelt er kulhydrater polymerer, der findes i forskellige former, såsom monosaccharider, disaccharider og polysaccharider. På den anden side er lipid et ikke-polymert molekyle, der udgør et glycerolmolekyle og tre fedtsyrekæder.