Hovedforskellen mellem plasmid og kromosom er, at plasmidet er en cirkulær dobbeltstrenget ekstra-kromosomal DNA-struktur af bakterier, mens kromosomet er en velorganiseret trådlignende struktur, der indeholder genomisk DNA, der er tæt spolet med proteiner.
Bakteriecellen indeholder et kromosom og flere ekstra-kromosomale DNA-cirkler kaldet plasmider. Bakteriekromosom indeholder bakteriens genomiske DNA. Desuden findes eukaryotisk genomisk DNA også som kromosomer. Det menneskelige genom har 46 kromosomer. Generelt er plasmider til stede i bakterier og arkæer. Selvom bakterier har plasmider, indeholder plasmider ikke de gener, der er essentielle for bakteriens overlevelse og deres vigtigste funktioner. Imidlertid indeholder plasmider adskillige gener, der giver yderligere fordele til bakterier såsom antibiotikaresistens, tørke tolerance, herbicidresistens osv. Formålet med denne artikel er at diskutere forskellen mellem plasmid og kromosom i detaljer.
