Hovedforskellen mellem atomer og partikler er, at atomer er små enheder lavet af flere partikler, mens partikler er små portioner af stof.
Et atom er den mindste enhed af alt stof. Tidligere troede folk, at atomet var den mindste ting, der findes, og vi kan ikke nedbryde det yderligere. Men ifølge nylige forskningsundersøgelser er atomet lavet af flere små partikler kaldet subatomære partikler. Imidlertid henviser udtrykket partikel i kemi til ethvert lille lokaliseret objekt, der har fysiske egenskaber såsom volumen, tæthed og masse.