Hovedforskellen mellem contig og stillads er, at en contig ikke har huller, mens et stillads består af contigs og huller.
Genomsekventering af flercellede organismer er meget vanskelig sammenlignet med sekventering af encellede organismer. Hele-genom haglgeværsekventering er en nem og hurtig genom-sekventeringsteknik til flercellede genomer. Det er en metode, der sekvenserer mange overlappende DNA-fragmenter parallelt. I denne metode samles små fragmenter i større fragmenter og derefter i større contigs ved hjælp af en computer. Derefter samles kontigerne i stilladser og til sidst i et kromosom. Derfor er contig en kontinuerlig strækning af nukleotidsekvenser, mens stilladset er en del af genomet, der består af kontig og huller. Både contig og stillads er rekonstruerede genomiske sekvenser.