Hovedforskellen mellem D og L glucose er, at i D-glucose er tre hydroxylgrupper og en hydrogengruppe i højre side, mens de tre hydroxylgrupper og en hydrogengruppe er i venstre side i L-glucose.
“D” og “L” bogstavsangivelse i navnene på D-glucose og L-glucose bruges til at skelne mellem de strukturelle forskelle i glucosemolekylet. Disse to former kaldes enantiomerer, fordi deres molekylære strukturer er spejlbilleder af hinanden. Derfor ligger nøgleforskellen mellem D- og L-glukose i deres struktur. Vi kan forklare forskellene i deres former ved hjælp af Fisher-projektionsmodellen; det er en af måderne til at tegne organiske molekyler.