Hovedforskellen mellem mesenkymale og hæmatopoietiske stamceller er, at mesenkymale stamceller kan differentiere sig i neuroner, knogle-, brusk-, muskel- og fedtvævsceller, mens hæmatopoietiske stamceller kan differentiere sig til alle typer blodceller i vores krop.
Stamceller er udifferentierede eller uspecialiserede celler, der findes i vores krop. De er i stand til at dele og give den samme type stamceller eller differentiere til specialiserede celler i væv, der har specificerede funktioner. På grund af disse bemærkelsesværdige evner hos stamceller bruges de til reparation og regenerering af beskadiget væv. Mesenkymale stamceller og hæmatopoietiske stamceller er to typer stamceller, der er ekstremt vigtige. Mesenkymale stamceller (ikke-hæmatopoietiske stamceller) er multipotente stamceller, der kan generere knogle-, brusk- og fedtceller. På den anden side kan hæmatopoietiske stamceller danne alle typer blodceller i kroppen. Desuden er begge disse stamcelletyper til stede i knoglemarven.
