Hovedforskellen mellem mikrospor og pollenkorn er, at mikrospor er den lille spore, der udvikler sig til den mandlige gametofyt i planter, mens pollenkorn er den lille korn, der indeholder den mandlige gametofyt.
Reproduktion af planter finder sted både seksuelt og aseksuelt og viser generationens veksling. Der er to generationer kendt som sporofytisk generation og gametophytisk generation. Microspore og pollenkorn er to strukturer, der udvikler sig i løbet af disse to generationer. Microspore er en struktur af sporophytisk generation, mens pollenkorn er en struktur for gametophytic generation. Mikroskopet er heller ikke en gametophyte, mens pollenkorn er en gametophyte.
