Hovedforskellen mellem fenetik og kladistik er metoden, der anvendes til klassificering af organismer. Fenetik klassificerer organismer baseret på morfologiske og strukturelle træk, mens kladistik klassificerer organismer baseret på deres herkomst og evolutionære forhold.
Klassificering af organismer er en vigtig proces i biodiversitet og biologiske studier. Taxonomi letter klassificeringen af forskellige systemer, samtidig med at det hjælper med klyngedannelse og gruppering af organismer. I denne henseende spiller fænetik og kladistik en vigtig rolle i opbygningen af relationer mellem organismer.
