Hovedforskellen mellem UPGMA og nabotilslutningstræ er typen af fylogenetisk træ, der er resultatet af hver metode. UPGMA er teknikken til at konstruere et rodfyldt fylogenetisk træ, mens nabo, der slutter sig til træ, er teknikken til at konstruere et urotet fylogenetisk træ.
Fylogenetiske træer er trælignende diagrammer, der viser evolutionære forhold mellem organismer. Et fylogenetisk træ kan have forskellige topologier afhængigt af den teknik, der anvendes til trækonstruktion. UPGMA og nabotilslutningstræ er to hovedmetoder, der bygger fylogenetiske træer.
