Hovedforskellen mellem stiftereffekt og flaskehalseffekt er, at stiftereffekten opstår, når en lille gruppe i en befolkning splinter fra den oprindelige befolkning og danner en ny, mens flaskehalseeffekten opstår, når befolkningen trækker sig markant sammen i en mindre størrelse pga. naturkatastrofer såsom jordskælv, oversvømmelser og brande.
Genetisk drift er et fænomen, der er meget mere sandsynligt at forekomme i små populationer og mere usandsynligt at forekomme i store populationer. Grundlæggende forekommer det på grund af tilfældige ændringer i allelfrekvenser, som kan føre til forsvinden af nogle gener fra små populationer. I sidste ende forårsager genetisk drift mindre genetisk mangfoldighed og variation i populationer. det medfører også, at nogle genvarianter forsvinder fuldstændigt fra populationerne. Desuden kan det medføre, at nogle sjældne alleler bliver hyppigere end før og endda fikseres. Der er to typer genetisk drift som flaskehalseffekt og grundlæggereffekt. De forårsager ekstreme reduktioner i befolkningen.
