Hovedforskellen mellem ovariecyklus og menstruationscyklus er, at ovariecyklussen er den cyklus, der sker i æggestokkene, mens menstruationscyklussen er den cyklus, der sker i livmoderen forbundet med livmodervæggen.
Ovariecyklus og menstruationscyklus er to cyklusser, der forekommer hos kvinder. Disse to cyklusser forbereder en kvinde til at blive gravid og føde et afkom og blive mor. Begge cyklusser forekommer i det kvindelige reproduktive system. De er således hormonresponsive cyklusser. Kvinder gennemgår disse to cyklusser fra puberteten til overgangsalderen. Serien af begivenheder finder sted i løbet af disse to cyklusser, og de drives hovedsageligt af hormonerne. Når graviditeten opstår, stopper begge cyklusser, og dette udføres af hormonet kaldet humant choriongonadotropin (hCG).
