Hovedforskellen mellem allozymer og isozymer er, at allozymer er kodet af forskellige alleler på samme sted. Men derimod kodes isozymer af gener på forskellige steder.
Enzymer er biokatalysatorer, der fremskynder biokemiske reaktioner. Faktisk er de proteinmolekyler kodet af gener. Der er forskellige typer enzymer. Nogle enzymer kodes af forskellige alleler af det samme gen, der er til stede på det samme sted. De er kendt som allozymes. I modsætning hertil er nogle enzymer kodet af forskellige gener placeret på forskellige steder. Disse enzymer er kendt som isozymer. Isozymer og allozymer kan bruges til at bestemme forholdet mellem to organismer.
