Hovedforskellen mellem RP HPLC og HIC er, at RP HPLC bruger en mere polær mobil fase og en mindre polær stationær fase. Mens HIC bruger en hydrofob stationær fase, der tillader de hydrofobe molekyler at fæstne sig til den.
Kromatografi er en analytisk teknik, der hjælper med at adskille en blanding i dens komponenter. Først skal vi opløse prøven, der skal adskilles, i en opløsning. Denne opløsning-stof-blanding kaldes den mobile fase. Derefter føres den mobile fase gennem et andet materiale kaldet den stationære fase. Den stationære fase bestemmer adskillelsen af komponenterne. Adskillelsen sker på grund af opdeling af materiale mellem den mobile fase og den stationære fase.