Hovedforskellen mellem omvendt fase og normal fase HPLC er, at omvendt fase HPLC bruger en ikke-polær stationær fase og en polær mobil fase, mens den normale fase HPLC bruger en polær stationær fase og en mindre polær mobil fase.
Den normale fase HPLC er den ældste HPLC-teknik, som Tswett brugte i sine separationer af planteekstrakter; han brugte kridt i en glaskolonne. Dette var den klassiske form for kromatografi, der førte til at navngive den som den "normale" teknik. Omvendt fase HPLC er derimod det modsatte af den normale teknik, som forskere udviklede for nylig.
