Hovedforskellen mellem grundlæggende og effektivt reproduktionsnummer er, at grundlæggende reproduktionsnummer (R 0) er reproduktionsnummeret, når der ikke er immunitet mod tidligere eksponeringer eller vaccination, mens effektivt reproduktionsnummer (R) er reproduktionsnummeret, når der er en vis immunitet eller noget interventionsforanstaltninger på plads.
Smitsomme sygdomme spredes let blandt befolkninger. Nogle sygdomme er epidemi, mens andre er pandemi. En epidemi er et regionalt udbrud af en smitsom sygdom, mens en pandemi er en verdensomspændende spredning af en smitsom sygdom. Reproduktionsnummer er et mål, der ofte bruges til at afspejle, hvor smitsom sygdommen er. Grundlæggende reproduktionsnummer (Ro) og effektivt reproduktionsnummer (R) er to epidemiologiske matricer, der bruges til at beskrive smitsomme agenser.