Hovedforskellen mellem genokopi og fænokopi er, at i genokopier viser fænotyper lighed, og genotypen ændres, mens fænotyper i fænokopi varierer, og genotypen forbliver uændret.
Forskellen mellem genokopi og fænokopi er involveret i forklaringen af de sjældne forekomster af genetik. De to begreber viser, hvordan traditionel genetik eller Mendelian genetik kan variere baseret på undtagelserne i naturen. Genokopi henviser til fænomenet at give en lignende fænotype på trods af at have en anden genotype. I modsætning hertil henviser fænokopi til fænomenet at have forskellige fænotyper på trods af at genotypen forbliver uændret.
