Hovedforskellen mellem DNA og RNA-nukleotid er, at DNA-nukleotid eller deoxyribonukleotid indeholder deoxyribosesukker, mens RNA-nukleotid eller ribonukleotid indeholder ribosesukker.
Nukleotider er den basiske enhed af nukleinsyrer. De er byggestenene eller monomerer af DNA og RNA. De forbinder med hinanden for at danne en polynukleotidkæde, som giver strukturen til DNA eller RNA. Der er tre hovedkomponenter i et nukleotid. De er en nitrogenholdig base, et pentosesukker (fem kulstofsukker) og fosfatgrupper. Der er fem forskellige nitrogenholdige baser som adenin, thymin, cytosin, guanin og uracil. Thymin ses kun i DNA, mens uracil er unik for RNA. Der er to typer af fem kulstofsukker i nukleinsyrer. RNA indeholder ribosesukker, mens DNA indeholder deoxyribosesukker. Nukleotider indeholder tre fosfatgrupper bundet til pentosesukkeret.
