Hovedforskellen mellem mutagen og teratogen er, at mutagen er et stof eller et middel, der forårsager en ændring i sekvensen af DNA'et hos et individ, mens et teratogen er et middel, der forårsager skade på fosteret eller det udviklende embryo under graviditeten.
Mutagener og teratogener er normalt kemiske stoffer. Imidlertid kan fysiske og biologiske midler også virke som et mutagen eller et teratogen. Begge disse kan føre til meget skadelige eller dødelige virkninger hos enkeltpersoner. Imidlertid har forbedringen af bioteknologi givet ny indsigt i både begreberne mutagener og teratogener.
