Hovedforskellen mellem molekylær docking og scoring er, at docking er en teknik, der bruges til at bestemme bindingsaffiniteten mellem to molekyler, mens scoring er en proces til evaluering af en bestemt positur ved at tælle antallet af gunstige intermolekylære interaktioner.
Udtrykkene molekylær docking og scoring bruges inden for molekylær modellering. Molekylær modellering er en teknik, der anvendes til at bestemme de mulige arrangementer af forskellige molekyler i et givet stof. Denne teknik er vigtig for at skabe nye stabile forbindelser.
