Hovedforskellen mellem molekylær orbitalteori og hybridiseringsteori er, at molekylær orbitalteori beskriver dannelsen af bindings- og anti-bindingsorbitaler, mens hybridiseringsteori beskriver dannelsen af hybridorbitaler.
Der er forskellige teorier udviklet til at bestemme de elektroniske og orbitale strukturer af molekyler. VSEPR-teori, Lewis-teori, valensbindingsteori, hybridiseringsteori og molekylær orbitalteori er så vigtige teorier. Den mest acceptable teori blandt dem er den molekylære orbitalteori.
