Nøgleforskel - YAC vs BAC-vektorer
Vektorer anvendes til molekylær kloning. En vektor kan defineres som et DNA-molekyle, der opfører sig som et middel til at føre fremmed genetisk materiale ind i en anden celle. En vektor, der indeholder fremmed DNA, er kendt som rekombinant DNA, og den skal have evnen til at replikere og udtrykke det i værtsorganismen. Gær kunstigt kromosom (YAC) og bakterielt kunstigt kromosom (BAC) er to typer vektorer involveret i kloning. Hovedforskellen mellem YAC og BAC er, at YAC er et kunstigt konstrueret vektorsystem, der bruger et specifikt område af gærkromosom til at indsætte store segmenter af genetiske materialer i gærceller, mens BAC er et kunstigt konstrueret vektorsystem, der bruger en specifik region af E. coli-kromosom at indsætte store DNA-segmenter i E. coli-celler.
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er YAC-vektorer
3. Hvad er BAC-vektorer
4. Sammenligning side om side - YAC vs BAC-vektorer
5. Resume
Hvad er YAC-vektorer?
YAC (gær kunstigt kromosom) er et kunstigt bygget kromosom, som har evnen til at bære et stort segment af fremmed DNA og replikere inden i gærcellerne. Det har en centromer, telomerer såvel som autonome replikerende sekvenser, der er vigtige for replikation og stabilitet. YAC bør også bære en selektiv markør eller markører og begrænsningssteder for at gøre det til en effektiv kloningsvektor. En stor sekvens, der spænder fra 1000 kb til 2000 kb, kan indsættes i YAC og overføres til gær. Transformationseffektiviteten af YAC er meget lav.
Figur 01: YAC-vektor
Hvad er BAC-vektorer?
Bakterielt kunstigt kromosom (BAC) er et kunstigt konstrueret kromosom til molekylær kloning. Det har specifikke regioner af E. coli F plasmid, og det er cirkulært og superviklet. BAC er udviklet til at klone DNA-fragmenter til bakterier, især til E. coli. Det kan bære DNA-fragmenter med størrelser op til 300 kb. Sammenlignet med YAC har BAC-kloningsindsatser mindre størrelse. BAC'er blev udviklet i 1992, og det er stadig populært på grund af dets stabilitet og lette konstruktion. BAC'er er også nyttige til udvikling af vacciner.
Figur 02: BAC-vektor i molekylær kloning
Hvad er forskellen mellem YAC- og BAC-vektorer?
Diff artikel midt foran bordet
YAC vs BAC-vektorer |
|
| YAC er et genetisk konstrueret kromosom med anvendelse af gær-DNA med henblik på kloning. | BAC er et genetisk konstrueret DNA-molekyle, der bruger E. coli DNA til kloning. |
| Køn | |
| YAC'er blev designet til at klone store fragmenter af genomisk DNA i gær. | BAC'er blev udviklet til kloning af store genomiske fragmenter i Escherichia coli. |
| Indsæt længde | |
| YAC'er kan indeholde genomiske indsatser i megabase-størrelse. (1000 kb - 2000 kb). | BAC'er kan bære indsatser på 200–300 kb eller mindre. |
| Konstruktion | |
| YAC-DNA er vanskeligt at oprense intakt og kræver høj koncentration for at generere YAC-vektorsystem. | BAC er let at rense intakt og kan let konstrueres. |
| Kimerisme | |
| YAC'er er ofte kimære. | BAC'er er sjældent kimære. |
| Stabilitet | |
| YAC er ustabil. | BAC er stabil. |
| Ændringer | |
| Gærrekombination er meget gennemførlig og forbliver altid aktiv. Derfor kan det generere sletninger og andre omlejringer i en YAC. | E. coli-rekombination forhindres og tændes, når det er nødvendigt. Derfor reducerer det de uønskede omlejringer i BAC'er. |
| Vedligeholdelse | |
| Manipulering af rekombinante YAC'er kræver normalt, at YAC overføres til E. coli til efterfølgende manipulation. Derfor er det en besværlig proces. | BAC-modifikation forekommer direkte i E. coli. Så der er ikke behov for DNA-overførsel. Derfor er processen ikke besværlig. |
Resumé - YAC vs BAC-vektorer
YAC er blevet et vigtigt forskningsværktøj i kloning af processer på grund af dets evne til at klone store fragmenter af DNA i værtsorganismen. Imidlertid har YAC'er flere ulemper som vektorer såsom konstruktionsvanskeligheder, kimerisme, ustabilitet osv. Derfor har forskere udviklet BAC-vektorer for at overvinde disse problemer. BAC er konstrueret under anvendelse af specifikke regioner af E. coli-kromosom. Det er en stabil vektor og kan let konstrueres. Længden af DNA, som BAC kan håndtere, er dog op til 20 gange mindre end den for YAC. Dette er forskellen mellem YAC og BAC vektorsystemer. I dag foretrækkes BAC mere end YAC i laboratorierne.
