Hovedforskellen mellem Cosmid og Phagemid er på typen af sekvenser, den indeholder. Et kosmid indeholder et cos-sted og et plasmid. Derfor er det en hybridvektor, mens et phagemid er et plasmid, der indeholder en F1-replikationsorigin af F1-fagen.
Kosmider og fagmider bruges til kloningsformål, især til at klone større fragmenter af DNA. Disse anvendes i vid udstrækning især i kloning af gener, der er ansvarlige for produktionen af forskellige proteiner. Cosmider og fagemider replikeres enten alene som plasmider eller pakkes i virale partikler og replikeres derefter.
