Hovedforskellen mellem glyoxysomer og peroxisomer er, at glyoxysomer kun er til stede i planteceller og filamentøse svampe, mens peroxisomer er til stede i næsten alle eukaryote celler. Glyoxysomer er rigelige i planteceller af spirende frø, mens peroxisomer er rigelige i lever- og nyreceller.
Disse to organeller er mikrolegemer til stede i eukaryote celler. Glyoxysomer er specialiserede peroxisomer, der kun findes i planteceller og filamentøse svampe. Peroxisomer er organeller, der hjælper med at nedbryde lange fedtsyrekæder og afgifte cellen. De nedbryder alkoholer og andre skadelige forbindelser.
