Hovedforskellen mellem Matlab og C-sprog er, at Matlab er et interaktivt computermiljø, mens C-sprog er et højt niveau programmeringssprog til generelle formål. Desuden bruges Matlab mest til videnskabelige og tekniske opgaver og er en betalt software, mens C-sprog er generelt formål og er open source.
Matlab er et miljø, der hjælper med at udføre matematiske beregninger som at løse differentialligninger, beregne integration, løse polynomer osv. Det giver forskellige kommandoer til at udføre transformationer som Fourier, Laplace, Inverse Laplace og at skabe forskellige plot. På den anden side er C et højt niveau programmeringssprog til generelle formål. Det bruges til at udvikle indlejrede systemer, databaser, operativsystemer, kompilatorer og netværksdrivere.