Hovedforskellen mellem fluorescens og phosphorescens er, at fluorescens stopper, så snart vi tager lyskilden væk, mens phosphorescens har tendens til at blive lidt længere, selv efter at den bestrålende lyskilde er fjernet.
Når et molekyle eller atom absorberer energi, kan det gennemgå forskellige ændringer. Fluorescens og phosphorescens er to sådanne processer. Ud over den ovennævnte nøgleforskel er der nogle andre forskelle mellem de to udtryk, såsom den energi, der frigøres i fluorescensprocessen, er højere end den i phosphorescens.