Hovedforskellen mellem NAG og NAM er, at N-acetylglucosamin (NAG) ikke har et pentapeptid bundet til sig, mens N-acetylmuraminsyren (NAM) har et pentapeptid bundet til sig.
Peptidoglycan er unik for bakterier, og det er den komponent, der er til stede i bakteriecellevæggen. I bakteriecellevæggen er der et lag peptidoglycan. Baseret på tykkelsen af dette lag adskiller bakterier sig i to hovedgrupper, der er vigtige i bakteriekarakteriseringen. I gram-positive bakterier er der et tykt peptidoglycanlag, mens der i gram-negative bakterier er et tyndt peptidoglycan-lag til stede. Peptidoglycan er en polymer sammensat af sukker og aminosyrer. N-acetylglucosamin (NAG) og N-acetylmuraminsyre (NAM) er to alternerende aminosukker til stede i peptidoglycan-laget af bakteriecellevæggen.